Dois aminoácidos se unem nas condições certas para formar um dipeptídeo. Se reagirmos glicina (gly) com alanina (ala) obtém-se uma mistura de 4 produtos: gly-ala, ala-gly, gly-gly e ala-ala.

Para obter exclusivamente o dipeptídeo gly-ala, é necessário proteger o grupo amino da glicina e o grupo ácido da alanina. Desta forma, a reação ocorrerá exclusivamente entre o grupo ácido da glicina e o grupo amino da alanina.

A proteção dos grupos amino e ácidos permite a obtenção seletiva do dipeptídeo gly-ala.